como hacer florwes personalizadas que hagan un motion que suba un puco y que el item no se pueda coger y se borre en X tiempo ¿COMO LO HAGO?

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Por lo que dices supongo que es en la 1.8, por que dices el nbt en cuestion "motion"
y que yo sepa solo funciona en la 1.8 hacia arriba.
Bueno supongo que a "Flower" te refieres al item tirado como entidad
En este caso tendrás que hacer los siguiente.

• /summon Item ~3 ~ ~  {CustomName:Saltamontes,Age:-0,PickupDelay:-0,Item:{id:"minecraft:dirt",Count:0}} (Cambia el minecraft:dirt, por el objeto que deses que spawne, en este caso flower minecraft:red_flower") = Item Que no despawnea y que no se puede coger, solo puedes eliminarlo con un kill @e[type=Item,name=Saltamontes]
•    Para el motion, usa: entitydata @e[type=Item,name=Saltamontes] {Motion:[0.0,1.0,0.0]} Ve probando las alturas
• [0.0,1.0,0.0] = (X Y Z) (Para que se borre en X tiempo, como dije usando el kill, pero si quieres justo pon los comandos en bloques de comandos, y con comparadores que den la ultima señal y un poco de repetidores, asi tardara mas)