Hola Davimen, creo que se pueden detectar usando un bloque de comandos repetidor con un entitydata para que en la flecha vaya montado un ArmorStand invisible y que no le afecte la gravedad, a este ArmorStand se le ejecutaría con execute (también en un bloque de comandos repetidor) un summon para que aparezca (en tu caso) un rayo en donde esta el jugador, en un radio pequeño para que no afecte a otros jugadores, luego se elimina el ArmorStand con kill para que no sigan cayendo rayos. Para que no caigan rayos al estar en el mismo sitio en el que esta una flecha que no dio en el blanco hay que usar un testfor para detectar cuando el Motion de la flecha es 0 y eliminar el ArmorStand.

Lo explico de esta manera porque no lo puedo probar en minecraft en este momento, ya que tengo un problema técnico con mi computadora, pero seguramente alguien más te podrá explicar mejor y darte los comandos, de todas formas espero haberte ayudado