El comando /replaceitem ha sido agregado en la snapshot 14w26a con el fin de ofrecer un montón de nuevas posibilidades para los MapMakers.

La caracteríastica general del comando /replaceitem, es que sustituye items en los inventarios de entidades y bloques.

La sintaxis de este nuevo comando ofrece dos posibilidades: una que afecta a las entidades y otra a los bloques (que puedan contener items en su interior):/replaceitem entity <selector> <slot> <item> [amount] [data] [dataTag]/replaceitem block [x] [y] [z] <slot> <item> [amount] [data] [dataTag]
En el /replaceitem block, debes especificar las coordenadas, el slot que vas a sustituir y el item por el cual lo vas a reemplazar.
Por ejemplo: Hay un cofre vacío en las coordenadas 0 5 0. Quieres meterle de forma no manual un stack de palas con el nombre de "Desenterrador" en el slot 13. Para ello debes utilizar el siguiente comando:/replceitem block 0 5 0 slot.container.13 minecraft:iron_shovel 64 0 {display:{Name:Desenterrador}}Una vez lo hayas ejecutado, el cofre tendrá 64 palas llamadas "Desenterrador" en el slot 13
Si lo que quieres ahora es vaciar nuevamente el slot de ese cofre o sustituirlo por otro, modifica el comando anterior con el ítem que quieras poner.
Nota: El ítem que representa un slot vacío es el aire (Id:0, Nombre:"minecraft:air").

Sólo hay ocho bloques que permiten interactuar mediante /replaceitem:

Bloque:	Caracteríaticas:
Cofre	Slots: 27 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: Sí
Horno	Slots: 3 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: En el primer slot
Dispensador	Slots: 9 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: Sí
Hopper	Slots: 5 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: Sí
Beacon	Slots: 1 Detectado por Comparador: No Normalidad: No
Cofre Trampa	Slots: 27 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: Sí
Dropper	Slots: 9 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: Sí
Brewing Stand	Slots: 4 Detectado por Comparador: Sí Normalidad: No

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El uso de /replaceitem en entidades ofrece muchas más posibilidades:
Su aplicación principal será editar los mobs de forma instantánea con los items que queramos:

Para escoger los mobs que deseamos modificar, éstos deberán tener alguna característica que los diferencie del resto:

Característica:	Detalles:	Argumento:
Diferente situación	Discrimina aquellos mobs que no cumplan una cercanía delimitada por el radio deseado.	r
Tipo determinado	Escoge sólo a aquellos mobs que compartan una misma clase.	type
Con un valor de scoreboard determinado	Todos aquellos mobs que tengan el valor deseado en el scoreboard escogido serán modificados.	score_<Nombre del Scoreboard> / score_<Nombre del Scoreboard>_min
Pertenencia a un equipo	Los mobs que estén en un equipo podrán ser modificados.	team
Posición	Los mobs que se encuentren en unas coordenadas concretas.	x,y,z / dx,dy,dz
Nombre	Los mobs cuyo nombre sea el deseado.	name
Cantidad	Escoge como máximo el número dado.	c

El comando /replaceitem entity también modifica al jugador y, por lo consiguiente, a su EnderChest.
El EnderChest pertenece a cada jugador y, por lo tanto, habrá que indicarlo para modificarlo.


El comando /replaceitem emplea unos argumentos de selección del slot muy concretos.
Por eso agrego también una lista con todos los argumentos de slot posibles:

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Incluyo también un mapa que podéis descargar para probar todos estos comandos y ver aún más aplicaciones (la imagen anterior fue sacada en ese mismo mapa):
Descarga del Mapa: www.mediafire.com/KaliNuska/"/replaceitem command".rar

Me parece innecesario poner el autor de esta guía puesto que lo tienes en un recuadro al lado mismo del post.
Sí, con esto quiero decir que todo el contenido está hecho por un tal "KaliNuska" (que, casualmente soy yo).

También considero impertinente una respuesta que pretenda insinuar el robo de contenido cometido por el propio autor.

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Si te surge alguna duda con respecto al comando, comunícamela o busca en el mapa de explicación.