Si,si hay solución.

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Solución A
Paso Nº1: Ve a la Carpeta de MCEdit 0.1.X (con X me refiero al número que sea).En ella veras una carpeta que tiene de nombre MCEdit_dev-0.1.XbuildXXX.win32.Esa carpeta es la que tiene los archivos de la version anterior,y como consecuencia,los filtros.
Paso Nº2: Entra en la carpeta  MCEdit_dev-0.1.XbuildXXX.win32,y una vez dentro metete en filters.Dentro de la carpeta filters busca los filtros que metiste,ya que es ahi donde están,o deberían estar.
Paso Nº3: Una vez que hayas encontrado todos los filtros copialos,y pegalos en la carpeta appdata que esta al principio de todo,en la carpeta de MCEdit 0.1.X.Dentro de appdata hay otra carpeta  filters,y esa carpeta es donde deberás meter todos los filtros que hayas copiado,que descargues o que necesites.
Paso Nº4: Cierra la carpeta de  MCEdit 0.1.X. y abre MCEdit,casi seguro que una vez le des a filters te saldrán los filtros que has metido.Por si esto no te solucionó tu problema,aquí hay una solución alternativa 

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Solución B
Paso Nº1: Descarga de nuevo los filtros desde sus respectivas páginas.

Paso Nº2: Mete estos filtros dentro de la ya mencionada antes carpeta  appdata.
Paso Nº3: Abre MCEdit y comprueba si los filtros están donde tú dices.

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Espero haberte ayudado,Un saludo.

De nada para esto es una de las cosas para las que esta este foro para resolver dudas y eso.Un saludo!